AlleleID軟件通過排列次序定位DNA的差異位點，并查找蛋白質組間氨基酸的區域，專門為檢測研究病原體，細菌鑒定、物種鑒定以及生物門類辨識提供微 陣列(MICROARRAY)和定量聚合酶鏈反應(qPCR)試驗而設計。
