MCPRO -- 廣泛使用的專業級電子結構量化計算
最新版本: 2.0
MCPRO使用蒙特卡羅統計力學模擬氣相或溶液狀態下的多肽、蛋白質和核酸。它源于BOSS，但在殘基觀念上有更廣的用途。2.0版不包含構象搜索，量子力學或正則模式計算。MC模擬能在周期性溶劑箱中，或在溶劑團簇以及包括氣相的電解質的統一體中進行。能量極小化能應用幾種優化方法，包括共軛梯度法。MCPRO容許加入NMR約束條件（NOE和轉角），通過模擬退火精煉NMR結構。自由能的改變通過FEP計算來估計，并廣泛的應用在研究蛋白質-配體的結合上。提供了超過1000個常用的有機小分子和藥物分子的輸入文件。內含的腳本文件能夠從PDB, mol2 或者mol文件中流暢的產生BOSS/MCPRO的輸入文件。輸出的分子結構包括PDB或 mol格式，能夠非常容易的用標準圖形顯示程序展示，如XChemEdit, Rasmol, WebLab和Midas。
